蒋志清于9月13日到达广州，当天晋见孙文。
孙文道：“你终于回来了，家里的事情都忙完了？”
蒋志清道：“先母停柩在家，待11月下旬安葬，现在无甚事了。”
孙文道：“那就好！逝者已矣，来者可追。这些天大家都等着你，明天咱们就开会。”
次日举行的会议非常顺利，大家一致通过了蒋志清的北伐作战计划。
会后，孙文将蒋志清叫住：“你休息两天，看看哪天方便，你替我去征求一下竞存的意见。”
蒋志清听罢，不由皱起了眉头。阵炯明为了躲避孙文跑到了惠州，孙文不仅没有责怪他，反而派自己征求陈炯明的意见，这样做是不是太软弱了？
孙文劝道：“北伐没有他的支持可不行。”
无奈之下，蒋志清与陈炯明会面了。这是一次令蒋志清非常憋闷的会面，陈炯明对北伐一事只是虚与委蛇地应付了一下，然后却大谈“联省自治”。
蒋志清心里暗笑：什么“联省自治”，还不是联“督”割据，军阀割据会造就一个联邦共和国？简直是痴人说梦。
不过，由于彻底看清楚了陈炯明的面目，出于对他的彻底绝望，蒋志清没有发作，他已清楚地知道他面前的陈炯明肯定会成为孙文的敌人，有一天自己一定会与他在战场上分个高下。蒋志清和气地与陈炯明握了握手，告辞而去。
蒋志清回到广州见到孙文的第一句话就是：“北伐断不可行。陈炯明必反。”
孙文惊道：“何出此言？”
蒋志清道：“他跟您不是一心。现在他手握两广，除了想据地自雄，难道还要陪您完成国民革命吗？”
孙文道：“我何尝不知他跟我不是一心。他志在两广。我志在天下。两广他要是想要，我可以给他，他帮助我北伐就行。”
蒋志清道：“两广您都拿不住，又何尝可以北伐？”
孙文笑道：“志清呀，你过虑了。存毕竟是跟我出生入死的老朋友，在统一问题上，我主张急进。他主张缓进，但大方向是一致的。你不要太悲观了。”
打这以后，孙文每天都要请蒋志清到他的住处商谈几个小时。每每谈到陈炯明已答应的补给问题，蒋志清就觉得十分烦恼，尤其是孙文还一边不断地称赞陈炯明。
蒋志清说：“您应当撤除陈炯明的总司令职务，藉以削减他的势力。下一道命令。使我可以首先快速出击。强制他离开职务，接掌他的军队指挥。这件事完成之后，北伐就可付诸实施，再无阻碍。”
“但是陈炯明还没有公开反对我，所以最好不要制造事端。他的部队是我的同胞兄弟，曾经多年与我并肩奋斗。你怎可提出如此的建议？真是不可思议！现在，你听我讲。”
孙文就不慌不忙地告诉蒋志清：“达致和谐的第一要件，就是信任、容忍、愿意了解对方的见解、在公开场合讨论问题。而不是在心胸中怀有无凭无据的猜疑或痛恨，而将这些当作确定事实一般。传达出去。你如要好好地为我工作，就应当全心全力地合作，而不可想逼我去同一位多年来显然忠诚的军官弟兄斗争！”
“但是，我看得出，陈炯明不久会有一天转而反对你。”蒋志清也相当激动。
“这种话对我们只有害多利少。”孙文再说，“当然陈炯明的军队如受到很小的一点挑衅，就可首先出击，但我不会给他衅端。你必须了解：你这种莽撞而不负责任的建议，可以轻易地将广州陷入水深火热之中。我们没有猜疑仇恨的余地。我不愿听取你再三反对炯明的那种说词。但是我的确要恳求你采取一种谅解合作的真正精神。你是一位好的军略人才，应当集中心力于谋致和谐的策略。”
蒋志清眼见孙文态度如此坚决，已经无法使其转变心意他既有自己的无力回天，也有对孙忠奸不分的抱怨，更有对陈炯明不忠不仁之愤恨，一下子全升到了极点，只好拜辞而去，乘船返乡。
回到家乡后，经过半个多月的勘察，蒋志清选中了溪口西北北三里的白岩山鱼鳞岙中段一块平地。这里不仅是一块上佳的“甲字穴”，而且还是龙脉的所在，整个地形像一个弥勒佛，墓穴就点在弥勒佛的肚脐眼上。
找到了风水宝地，蒋志清让人加紧修建墓地，每日亲去监督。建墓的事情定了，蒋志清的心也安了下来，时间也似乎多了起来，于是又给三岁夭折的弟弟筑坟立碑。此外，蒋志清又将溪口的三个小学合并，改建为“武岭初等小学”。
蒋志清在家乡忙碌之时，在广州筹备北伐的孙文也取得了进展。1921年10月，孙文终于说服非常国会通过了北伐议案，但尚在南宁的陈炯明拒不执行。
孙文通过电话怒气冲冲地对陈炯明说：“粤军返粤之目的，不在光复一省之土地，实负有澄清中国之大责。”
对此，陈炯明不以为然，又说了一番先定省宪，才能确立民治基础的大道理。又说并不反对北伐，只是现在兵疲将惫，囊空如洗，根本不可能远征北方。
孙文郑重表示：“我叫孙大炮，大道理我比你讲得好，你就别跟我说了。中国人如果能有联省自治的素质，那么辛亥革命我们都不用搞了。但那可能吗？中国到现在还不是一盘散沙吗？算了，不说这个了，还是说北伐。北伐是我的决心，一切由我负责。假如北伐取得胜利，我不会回两广；假如失败了，我无颜再回两广。因此，